葉榕是一種廣泛分布于我國南方的植物。近日，中國農(nóng)業(yè)科學院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所農(nóng)業(yè)基因組學技術研發(fā)與應用創(chuàng)新團隊發(fā)布首個對葉榕的完整基因組，修正了此前學界對其基因組測序繪制中存在的大量間隙和組裝錯誤，大幅提升了對葉榕基因組的連續(xù)性、完整性和準確性，為榕屬植物性別演化提供了重要資源。
據(jù)介紹，榕樹是桑科榕屬800多種植物的統(tǒng)稱，廣泛分布于熱帶和亞熱帶地區(qū)。榕屬植物包含6個亞屬，一半雌雄同株（單棵榕樹上包含正常的雌花和雄花），一半功能性雌雄異株（雌榕樹僅含有雌花，雄榕樹包含雄花和短花柱雌花）。其中，對葉榕是聚果榕亞屬比較古老的雌雄異株植物，具有明顯的性別分化。從生物學角度看，解析對葉榕的基因組對研究榕屬植物性別分化及相關生物學性狀和基因功能至關重要，然而，此前對葉榕基因組存在大量的信息缺失和組裝錯誤，阻礙了進一步的研究。
在國家自然科學基金等項目的支持下，科研團隊綜合利用多種測序技術，在原有基因組基礎上重新組裝、完善，發(fā)布了首個對葉榕所有染色體端粒到端粒完整無間隙的基因組。該基因組大小371.8兆，所有序列均掛載到14條染色體上，成功注釋了26642個編碼蛋白基因，經(jīng)評估，基因組的完整度、連續(xù)性和準確性均得到了大幅提升。
另據(jù)了解，科研團隊還進一步組裝榕屬植物首個完整的性別決定區(qū)域，鑒定榕樹的性別決定基因，并構建對葉榕雄性和雌性花不同發(fā)育時期的基因調控網(wǎng)絡，從而發(fā)現(xiàn)雄花發(fā)育的關鍵基因。
